Гафурийский район расположен в центральной части Республики Башкортостан. Граничит с Архангельским, Белорецким, Ишимбайским, Стерлитамакским, Аургазинским, Кармаскалинским районами. Административный центр — с. Красноусольский, находится в 130 км к юго-востоку от г. Уфы. Площадь района 3038 кв. км, или 2,1% территории республики.
Расположенный на отрогах Южного Урала, район имеет богатую и живописную природу. Большая часть его территории - горно-лесная. Здесь располагаются много пещер, среди них - уникальная пещера Кандерля (“Победа”). По западным склонам гор стекают реки Зилим, Усолка, Зиган - притоки реки Агидели. На ее левобережье находится одно из крупнейших озер республики - Аккуль (Белое).
Красноусольские целебные источники еще в 16 веке пользовались широкой известностью во всем южном Предуралье. На этих родниках и образуемой ими речке Усолке действовали солеварни. Поваренная соль, добываемая там, расходилась отсюда на баржах вниз по р. Белой и в обозах во всех направлениях. Красноусольские минеральные источники находятся в долине речки Усолки в 5 км от пос. Красноусольский - центра Гафурийского района.
Административно-территориальное деление представлено 16 сельскими поселениями.